DrawMol 1.4.35

説明

タイトル:DrawMol
バージョン:1.4.35
開発者:UNamur
カテゴリ:教育
サブカテゴリ:科学
ダウンロード:603

評価 80% (Votes 332)
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コメント (9)

説明

  • DrawMol は、可視化し、分子構造を構築するための強力なグラフィカルインターフェースです。 機能 -ゼロから分子構造を構築 -クリックしてドラッグして原子と結合を追加することで構造を構築します。 -その後、構造を構築する UFF 力フィールド optimizationWhen を使用してワンクリックであなたの構造を絞り込むことができ、DrawMol はあなたのための債券の種類を推測することができます (シングル、ダブル、トリプルまたは芳香族結合) またはあなたが債券をクリックして、それを強制することができます。 -また、水素原子を自動的に添加することができます -Xyz 形式で構造体を保存するか、ガウスまたは gamess 入力ファイルを直接作成します。 -Gamess の場合、プログラムがローカルにインストールされている場合は、DrawMol (バックグラウンドで) からジョブを起動して、ジョブの進行状況に従うこともできます。 -DrawMolIt のデカルトエディタに構造を直接貼り付けて、XYZ、ガウス、Gamess、Turbomole、Z 行列の形式を認識することができます。 -デカルトエディタはまた、これらの形式のいずれかで構造を出力するだけでなく、いくつかの原子を追加/削除することによって、または与えられた atom 要素を変更することによって、特定の構造を変更するために使用することができます。 -ChemSpider データベースから構造体をインポートする -分子構造だけでなく、分子特性を可視化 -オープン XYZ、MDL molfile、ガウスログ、ガウス fchk、Gamess ログ、ダルトンアウト、Molpro アウトファイル形式。 -分子構造に加えて、DrawMol はさまざまな分子特性を読み取ることができます (現在はガウス fchk ファイル形式でのみ使用可能)。 -Mulliken 料金 -双極子モーメント -分極率とファースト hyperpolarizability -振動通常モード -磁気遮へい (NMR) -基底セットと LCAO 係数からの分子軌道 -分子特性の可視化: -アトムラベル -Mulliken 料金 -NMR 化学シフト -ダイポールモーメントベクトル -ベータベクトル ●分極率と hyperpolarizability のユニット球表現 ベクトル、球、あるいはアニメーションを介して振動通常モードの原子変位 -分子軌道アイソサーフェス -ガウスキューブファイルを開き、保存された日付のアイソサーフェスを視覚化します。 -さらに、DrawMol はいくつかのツールを提供します。 -マッチング・プロシージャを使用して互いに一致する2つの分子またはフラグメントを作成する (最小二乗アプローチ) -分子の Z 軸が、3つ以上の原子によって作られた平面に垂直になるように、または最小二乗法を用いて2つ以上の原子を通るように配向する。 -任意の構造を保存 -画像として、png、tiff、jpeg または dae (Collada) で -通常モードのアニメーションのための動画として -XYZ、CIF、PDB ファイルとして -Limol fileThis 形式は、基本的には、すべての分子特性だけでなく、可視化の好みを格納する HDF5 コンテナ (https://www.hdfgroup.org) です。 -このファイルは DrawMol で読み取ることができますが、C、Fortran、Python を使用して簡単に解析することもできます...さらに、(lidump ユーティリティを使用して) ASCII ファイルにダンプします。

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